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本文介紹一套結合 Zotero、Better Notes 與 Obsidian 的高效文獻研究工作流。Zotero 作為文獻管理的核心，負責收集、組織和引用文獻；Zotero GPT 插件利用 AI 技術輔助文獻分析，快速提取重點；Better Notes 插件則強化 Zotero 的筆記功能，提供 Markdown 編輯、多種匯出格式以及與 Obsidian 的雙向同步，成為連結 Zotero 與 Obsidian 的橋樑；Obsidian 則作為個人知識庫的建構平台，透過 Zotero Integration 插件導入文獻資訊和筆記，利用其強大的連結功能建立知識網絡。本文詳細說明了各軟體的安裝、設定步驟，並提供實際操作範例，旨在幫助研究人員和學生更有效地管理文獻、提升研究效率。
This article introduces an efficient literature research workflow integrating Zotero, Better Notes, and Obsidian. Zotero serves as the core for literature management, handling collection, organization, and citation. The Zotero GPT plugin utilizes AI to assist with literature analysis and quickly extract key points. The Better Notes plugin enhances Zotero’s note-taking capabilities, providing Markdown editing, multiple export formats, and two-way synchronization with Obsidian, acting as a bridge between Zotero and Obsidian. Obsidian functions as a platform for building a personal knowledge base, importing literature information and notes through the Zotero Integration plugin, and leveraging its powerful linking features to create a knowledge network. This article details the installation and setup steps for each software and provides practical examples, aiming to help researchers and students manage literature more effectively and improve research efficiency.
身為研究人員或學生，您是否常常為了管理大量的文獻而感到頭痛？如何在快速掌握文獻重點的同時，又能有效地組織筆記、建立個人知識庫？本文將介紹一套強大的文獻研究工作流，結合 Zotero、Better Notes 與 Obsidian 這三款工具，從文獻收集、AI 輔助分析、筆記整理到個人知識庫建構，全面提升您的研究效率。
Zotero：文獻管理的強大核心
Zotero 是一款免費、開源且跨平台的文獻管理工具，支援 Windows、macOS、Linux 等作業系統，並提供瀏覽器擴充功能，讓您輕鬆收集、組織、引用和分享研究資源。其自動化文獻資訊擷取、多樣的引用格式、協作功能以及豐富的插件生態系，使其成為研究人員不可或缺的利器。
Zotero 安裝：
- 前往 Zotero 官方網站 (https://www.zotero.org/) 下載對應您作業系統的安裝程式。
- 執行安裝程式，按照指示完成安裝。
- 建議同時安裝瀏覽器擴充功能，方便直接從網頁收集文獻。
插件安裝
下面以zotero GPT為例，其他的插件也是同樣的方式，先到官方網站搜尋xpi檔，並根據下面流程進行安裝即可。
- 前往 Zotero GPT 的 GitHub 頁面 (https://github.com/MuiseDestiny/zotero-gpt)。
- 在 “Releases” 頁面下載最新的
.xpi檔案。 - 在 Zotero 中，點選「工具」>「附加元件」。
- 點擊右上角的齒輪圖示，選擇「從檔案安裝附加元件」，然後選擇剛才下載的
.xpi檔案。
Zotero GPT：AI 助力，快速掌握文獻重點
Zotero GPT 是一個 Zotero 插件，它整合了大型語言模型 (LLM) 的技術，協助您更有效率地閱讀文獻。它類似於 ChatDOC 等文獻解讀服務，透過分析 PDF 內容，幫助您快速掌握文獻重點並產出筆記。
Zotero GPT 使用方法：
- 安裝完成後，使用
cmd-/(macOS) 或ctrl-/(Windows) 啟動插件，使用ESC退出。 - 在 Zotero 中選擇一個或多個文獻條目。
- 啟動 Zotero GPT 插件，它會自動分析選定的文獻。
- 您可以透過自定義 prompt 來更精準地提取資訊。在插件介面中輸入
#tag並按下ENTER，然後在下方輸入您的 prompt。
[[ChatPDF]]
請使用繁體中文，以清晰易懂的方式，用大綱方式總結以下問題，每個回應至少 300 字：
1. 針對主題，過去文獻尚未解決的問題。
2. 本文的研究動機與目的。
3. 本文的研究方法與特色。
4. 本文研究結果的摘要整理。
5. 本文研究的限制。
6. 本文研究的實際應用與研究應用。
7. 本文延伸出的研究方向。Better Notes：強化筆記功能，實現雙向同步的關鍵
Zotero 內建的筆記功能較為基礎，Better Notes 則是一款功能強大的 Zotero 插件，它大幅強化了筆記功能，使其更接近獨立的筆記應用程式，更重要的是，它提供了與 Obsidian 的雙向同步功能，這也是本工作流的核心。
Better Notes 的主要功能與優勢：
- Markdown 支援： 完整支援 Markdown 語法，包含標題、粗體、斜體、清單、程式碼區塊、連結、圖片、表格等，讓筆記更易讀且格式豐富。
- 即時預覽： 編輯 Markdown 筆記時，提供即時預覽功能。
- 多種匯出格式： 支援匯出為 Zotero 新筆記、Markdown 檔案、MS Word 文件、PDF 文件和 FreeMind 檔案。
- 筆記範本： 可使用 Markdown 建立筆記範本，提高筆記一致性。
- 雙向同步 (與 Obsidian)： 這是最重要的功能！任何在 Better Notes 或 Obsidian 中對筆記的修改都會自動同步，確保兩邊的筆記內容一致。
- 筆記連結： 支援在筆記之間建立內部連結。
- 搜尋功能： 提供筆記內文搜尋功能。
整合 Zotero GPT 與 Better Notes：
- 安裝 Zotero GPT 和 Better Notes 插件。
- 使用 Zotero GPT 分析文獻並產生文字。
- 將 Zotero GPT 產生的文字複製到 Better Notes 的筆記中。
- 在 Better Notes 中使用 Markdown 或其他格式來整理和編輯文字。
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Obsidian 與 Zotero Integration：連結文獻與知識，打造個人知識庫
Zotero Integration 安裝與設定：
- 在 Obsidian 中，點選左側邊欄的「設定」圖示。
- 在「社群外掛」頁面，關閉「安全模式」。
- 點擊「瀏覽」按鈕，搜尋 “Zotero Integration”。
- 點擊 “Install” 安裝。
- 安裝完成後，在「設定」>「社群外掛」中找到 “Zotero Integration” 進行設定。
- 重要： 必須先在 Zotero 中安裝 Better BibTeX for Zotero 插件 (https://github.com/retorquere/zotero-better-bibtex)，並設定自動匯出 BibTeX 檔案。
- 在 Zotero Integration 的設定中，指定 Better BibTeX 匯出的 BibTeX 檔案路徑。
Zotero Integration 的主要功能：
- 匯入文獻資訊： 使用指令或快捷鍵快速匯入 Zotero 條目，可選擇匯入作者、標題、年份、摘要、連結等資訊。
- 建立連結： 在 Obsidian 筆記中建立指向 Zotero 條目的連結 (
zotero://select/library/items/[Zotero Item Key])。 - 使用模板： 使用 Handlebars 模板語言自定義匯入格式。
- 匯入筆記和 PDF 註釋： 將 Zotero 條目的筆記和 PDF 註釋匯入 Obsidian。
- 更新文獻資訊： 在 Obsidian 中更新已匯入的文獻筆記。
- 自動更新引文: 透過設定可以讓Obsidian在背景自動更新引文資訊，確保資料的同步。
匯入文獻範例 (使用模板)：
在 Obsidian 中，使用指令 “Zotero: Import item”，選擇要匯入的文獻。可以以下是我個人模板：
# {{title}}
## Metadata
journal: {{publicationTitle}}
date: {{dateModified}}
authors: {{authors}}
citation key: [[{{citationKey}}]]
url: {{url}}
DOI: {{DOI}}
fileURL: {{desktopURI}}
{% if abstractNote %}
## Abstract
{{abstractNote}}
{% endif %}
## Note
{{markdownNotes}}
完整工作流程：以 Zotero 為核心的知識庫建構
- 文獻收集與初步分析： 使用 Zotero 管理文獻，並使用 Zotero GPT 進行初步的文獻分析和摘要，快速掌握文獻重點。
- 筆記整理與強化： 將 Zotero GPT 產生的文字複製到 Better Notes 中，利用 Better Notes 提供的 Markdown 編輯、多種格式支援、筆記範本等功能，進行更詳細的整理、編輯和排版，使筆記更清晰、易懂。
- 知識庫建構與連結： 透過 Zotero Integration 插件，將文獻資訊和 Better Notes 中編輯好的筆記匯入到 Obsidian 中。利用 Obsidian 強大的連結功能，將相關筆記串聯起來，建立個人化的知識網絡。由於 Better Notes 提供了與 Obsidian 的雙向同步，因此在 Obsidian 中對筆記的修改也會同步回 Zotero 的 Better Notes 中，保持資料的一致性。
結論
Zotero GPT、Better Notes 與 Obsidian 的整合，提供了一個強大且靈活的文獻研究解決方案。透過 AI 輔助分析、豐富的筆記編輯功能以及強大的知識庫建構能力，使用者可以更有效地管理文獻、提取重點、建立連結，並最終提升研究效率。Better Notes 的加入，更完善了筆記編輯和管理的部分，使整個工作流程更加流暢和高效。